甘孜州九龙县吉日寺的来历，最早可追溯到清康熙年间，当时九龙地区属康巴藏区，藏传佛教宁玛派的僧人在当地传教，吸引了不少信众，一位名叫噶玛扎西的宁玛派高僧，带着弟子来到九龙县的吉日河谷，发现这里山清水秀、地形开阔，适合修建传法的寺院，信众们听说后，纷纷拿出木料、土石等材料帮忙，耗时三年多,在清康熙二十七年建成了最初的吉日寺。
吉日寺建成后，很快成为当地宁玛派的活动中心，附近村寨的藏民会定期来这里听经、祈福，寺院还会组织僧人给村民讲解藏传佛教的基本教义，指导大家进行日常的宗教活动，不少远道而来的信众，会在吉日寺附近的山坡上搭起帐篷，住上几天，参与寺院的法会，这也带动了当地小型贸易的发展，一些商贩会带来盐巴、茶叶等物品和村民交换。
甘孜州九龙县吉日寺的来历里，名称的由来和当地的自然环境紧密相关。“吉日”在藏语里是“吉祥如意”的意思，当初建寺时，河谷里常年有一股清澈的泉水，当地藏民觉得这泉水是吉祥的象征，就把这片河谷叫做“吉日”，寺院建在河谷的台地上，所以就直接取名为吉日寺,希望寺院能给当地带来平安和好运。
后来寺院扩建时，当地的头人也参与了进来，他们还专门请了宁玛派的高僧给寺院的名称做了加持，高僧说，这个名字符合当地的风土人情，也契合信众的心愿，能让寺院的香火越来越旺，现在当地的藏民提到吉日寺，都会自然地和“吉祥”联系在一起，不少人家里还会挂着吉日寺的唐卡,祈求家人平安。
甘孜州九龙县吉日寺的来历，还和寺院的传承制度有关，从建成开始，吉日寺就实行活佛转世制度，每一代活佛都会负责寺院的教务和管理，民国时期，吉日寺的第九世活佛，曾经带领当地信众抵御过土匪的侵扰，保护了附近村寨的安全,在当地很受敬重。
新中国成立后，吉日寺的发展逐渐走上正轨，政府给寺院拨了修缮资金，不少信众也主动帮忙整理寺院的房屋和院落，现在吉日寺有三十多名僧人，他们除了日常的宗教活动，还会给当地的孩子教授藏文和基本的佛教知识，每年藏历六月，寺院还会举办传统的跳神法会，附近的藏民都会赶来参加,场面很热闹。
去甘孜州九龙县吉日寺参观，最好提前了解当地的宗教习俗，比如进入寺院要脱鞋，不能随意触摸僧人或宗教器物，如果想参与法会，要听从寺院僧人的引导，不要大声喧哗，要是想了解更多吉日寺的历史，可以找当地的老人聊聊，他们大多能讲出不少和寺院相关的故事，这些内容比书本上的更生动,也更能感受到吉日寺和当地生活的联系。